Hans første kone var enke efter sognepræst Lars Gregersen Fog.

Han blev gift 2 gang i Vejle 16. December 1727 med Charlotte Amalie Hansdatter Curtz. Hun var enke efter sognepræst Niels Eskildsen Busch.

Dim 1697 i Århus, 19. Juni 1705 Sognepræst Jelling-Hover, 1709 Provst Tørrild Herred, 5. August 1724 Sognepræst i Vejle-Hornstrup, 1733 Provst Nørvang Herred.

Høyer blev kaldet 1705 til Jelling af Krigskommissær Nissen, Rugballegård, som sammen med Lerbæk ejede Hover Kirke. Morville, Brandbjerg anlagde sag, da man ikke havde taget hensyn til hans kaldsret til Jelling Kirke. Højesteret stadfæstede valget.

Han var en fortræffelig prædikant, mange fremmede kom til Jelling kirke for at høre ham. I hans tid besøgte Frederik IV flere gange Byen, i 1721 i anledning af en udgravning i nordhøjen. Anna Sophie Rewentlow, der netop var blevet viet til kongens højre hånd, var med, og nu ønskede kongen, at Høyer skulle sætte hende lidt ind Jellings Mindemærkers historie. Samtidig besteg selskabet begge høje; men bagefter syntes han slet ikke, han havde fået sagt det, han gerne ville. Derfor sendte han senere en skriftlig beretning til den unge dronning med et indtagende digt, som erindrede om den forpustede højbestigning – og præstens anstrengelser for at forklare.

Da han 1724 blev sognepræst i Vejle var han en holden mand og ejede udover embedets indtægter fra flere gårde, som han forpagtede ud, bl.a. til Fredericia Kommandant, ligesom han bortfæstede Vejle Mølle. Hans helbred var ikke godt, hvilket satte sig spor i hans arbejdsindsats. I 1743 var Biskop Brorson på Visitats og selv om han prædikede “bevegelig”, bemærkede Brorson, at han var blevet gammel og agtede at tage sig en “Huuscapellan”, ligesom ungdommen efter Brorsons opfattelse kun svarede “skikkelig”.

Da han i 1746 androg om en personlig kapellan, foreslog han i prioteret rækkefølge: 1) Hans Eskildsen Busch (søn af hans 2 kone), som han selv kalder “sin søn ” (stedsøn ) og muligvis adopteret, og 2) Hans H. Neuchs. men Brorson valgte til hans store fortrydelse Neuchs.